跳至內容

希拉蒂亞·達薩馬

維基百科，自由的百科全書
希拉蒂亞·達薩馬
Shiladitya DasSarma
出生 (1957-11-11) 1957年11月11日（67歲）
 印度加爾各答
國籍 美國
母校印第安納大學布盧明頓分校（英語：Indiana University Bloomington）（BS）
麻省理工學院（PhD）
知名於鹽桿菌綱、氣候行動
獎項瑪格麗特·馬克維卡獎（英語：Margaret MacVicar）
科學生涯
研究領域分子生物學
機構馬里蘭大學

希拉蒂亞·達薩馬（英語：Shiladitya DasSarma，1957年11月11日—）是一名印度裔美國分子生物學家，因其對嗜鹵和嗜極微生物生物學的貢獻而知名[1][2]。他是馬里蘭大學巴爾的摩分校（英語：University of Maryland, Baltimore）的教授。他擁有印第安納大學布盧明頓分校（英語：Indiana University Bloomington）化學學士學位和麻省理工學院生物化學博士學位。在擔任教職之前，他曾在麻省總醫院、哈佛醫學院和巴黎巴斯德研究院從事研究工作。

達薩馬曾在麻薩諸塞大學阿默斯特分校（1986年—2001年）、馬里蘭大學生物技術研究所（英語：University of Maryland Biotechnology Institute）（2001年—2010年）和馬里蘭大學醫學院海洋與環境技術研究所（2010年—至今）任教。他是分子遺傳學、基因組學和生物資訊學的研究員和教師，也是本科生、研究生、博士後和青年教師的導師。他在嗜鹽生物（英語：Halophile）[3]和嗜極生物研究領域的奠基作用廣為人知。

研究工作

嗜鹽生物

1980年代，達薩馬在麻省理工學院與哈爾·葛賓·科拉納和烏塔姆·L·拉吉班達里（Uttam L. RajBhandary）一起攻讀研究生期間，發現嗜鹽古細菌中的移動遺傳因子[4][5]。他也發現古細菌[6]的轉錄啟動子與普通細菌的轉錄啟動子不同，這有助於人們接受卡爾·烏斯所提出的三域演化觀點。

1990年代，他組織並領導團隊破解第一個嗜鹽微生物--鹽桿菌NRC-1的基因組序列和遺傳密碼[7][8][9]。這項工作表明，它的蛋白質具有很強的酸性，讓人們了解到蛋白質在高鹽度和低水活性條件下是如何發揮作用的[10][11][12]。基因組序列發現了古細菌與高等真核生物的相似之處以及與細菌的不同之處，從而進一步確定古細菌的有效性[13]。

2000年代後期，他的工作也表明某些基因是透過水平基因轉移獲得的，例如有氧呼吸基因。他實驗室的後基因組研究確定了嗜鹽古細菌的核心蛋白質和特徵蛋白[14]，以及許多基因和遺傳因子的功能，包括多個複製起源[15]、一般轉錄因子[16]和DNA修復系統[17][18]。

天體生物學

2010年代，達薩瑪對南極嗜鹽微生物Halorubrum lacusprofundi（英語：Halorubrum lacusprofundi）的研究進一步加深人們對高鹽度和低溫條件下蛋白質功能的理解[19]。這些研究可以解釋生命如何適應新環境，包括地外環境[20]。

他提出最初在嗜鹽古細菌中發現的視黃醛色素可能早於早期地球的葉綠素色素，並將其命名為「紫色地球假說」[2][21]。這項提議為遠端探測生命提供了一個潛在的新生命印跡。

生物技術

達薩馬的實驗室在研究Halobacterium sp. NRC-1中的浮力氣囊奈米顆粒 (GVNPs) 方面發揮重要作用，並開發了一種表達系統，用於生物工程GVNPs的生物技術應用[22]。這些奈米粒子可能是抗原遞送、疫苗開發及其他生物醫學和環境應用的寶貴平台[23][24]。

參考資料

  1. ^ Extreme Halophiles Are Models for Astrobiology (PDF). Microbe. 2006 [2023-12-17]. （原始內容存檔 (PDF)於2016-08-07）. 
  2. ^ 2.0 2.1 Extreme Microbes » American Scientist. www.americanscientist.org. [2016-07-11]. （原始內容存檔於2017-06-19）. 
  3. ^ DasSarma, Shiladitya; DasSarma, Priya. Halophiles. John Wiley & Sons, Ltd. 2001-01-01. ISBN 9780470015902. doi:10.1002/9780470015902.a0000394.pub3 （英語）. 
  4. ^ Simsek, M.; DasSarma, S.; RajBhandary, U. L.; Khorana, H. G. A transposable element from Halobacterium halobium which inactivates the bacteriorhodopsin gene. Proceedings of the National Academy of Sciences. 1982-12-01, 79 (23): 7268–7272. Bibcode:1982PNAS...79.7268S. ISSN 0027-8424. PMC 347320 可免費查閱. PMID 6296826. doi:10.1073/pnas.79.23.7268 可免費查閱 （英語）. 
  5. ^ DasSarma, S.; RajBhandary, U. L.; Khorana, H. G. High-frequency spontaneous mutation in the bacterio-opsin gene in Halobacterium halobium is mediated by transposable elements. Proceedings of the National Academy of Sciences. 1983-04-01, 80 (8): 2201–2205. Bibcode:1983PNAS...80.2201D. ISSN 0027-8424. PMC 393786 可免費查閱. PMID 6300900. doi:10.1073/pnas.80.8.2201 可免費查閱 （英語）. 
  6. ^ DasSarma, Shiladitya; RajBhandary, Uttam L.; Khorana, H. Gobind. Bacterio-opsin mRNA in wild-type and bacterio-opsin-deficient Halobacterium halobium strains. Proceedings of the National Academy of Sciences. 1984-01-01, 81 (1): 125–129. Bibcode:1984PNAS...81..125D. ISSN 0027-8424. PMC 344623 可免費查閱. PMID 16593404. doi:10.1073/pnas.81.1.125 可免費查閱 （英語）. 
  7. ^ Ng, WaiLap V.; Ciufo, Stacy A.; Smith, Todd M.; Bumgarner, Roger E.; Baskin, Dale; Faust, Janet; Hall, Barbara; Loretz, Carol; Seto, Jason. Snapshot of a Large Dynamic Replicon in a Halophilic Archaeon: Megaplasmid or Minichromosome?. Genome Research. 1998-11-01, 8 (11): 1131–1141. ISSN 1088-9051. PMID 9847077. doi:10.1101/gr.8.11.1131 可免費查閱 （英語）. 
  8. ^ Ng, Wailap Victor; Kennedy, Sean P.; Mahairas, Gregory G.; Berquist, Brian; Pan, Min; Shukla, Hem Dutt; Lasky, Stephen R.; Baliga, Nitin S.; Thorsson, Vesteinn. Genome sequence of Halobacterium species NRC-1. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2000-10-24, 97 (22): 12176–12181. ISSN 0027-8424. PMC 17314 可免費查閱. PMID 11016950. doi:10.1073/pnas.190337797 可免費查閱 （英語）. 
  9. ^ NSF - OLPA - PR 00-69: International Research Group Sequences Genome of Ubiquitous Microbe. www.nsf.gov. [2016-07-11]. （原始內容存檔於2023-12-17）. 
  10. ^ Kennedy, Sean P.; Ng, Wailap Victor; Salzberg, Steven L.; Hood, Leroy; DasSarma, Shiladitya. Understanding the Adaptation of Halobacterium Species NRC-1 to Its Extreme Environment through Computational Analysis of Its Genome Sequence. Genome Research. 2001-10-01, 11 (10): 1641–1650. ISSN 1088-9051. PMC 311145 可免費查閱. PMID 11591641. doi:10.1101/gr.190201 （英語）. 
  11. ^ Karan, Ram; Capes, Melinda D.; DasSarma, Shiladitya. Function and biotechnology of extremophilic enzymes in low water activity. Aquatic Biosystems. 2012-01-01, 8 (1): 4. ISSN 2046-9063. PMC 3310334 可免費查閱. PMID 22480329. doi:10.1186/2046-9063-8-4 可免費查閱. 
  12. ^ DasSarma, Shiladitya; DasSarma, Priya. Halophiles and their enzymes: negativity put to good use. Current Opinion in Microbiology. Environmental microbiology • Extremophiles. 2015-06-01, 25: 120–126. PMC 4729366 可免費查閱. PMID 26066288. doi:10.1016/j.mib.2015.05.009. 
  13. ^ DasSarma, S., J.A. Coker, and P. DasSarma. 2010. Archaea - Overview. In Encyclopedia of Microbiology, 3rd edition, Academic Press, M. Schaechter (ed.), p. 118-139.
  14. ^ Capes, Melinda D.; DasSarma, Priya; DasSarma, Shiladitya. The core and unique proteins of haloarchaea. BMC Genomics. 2012-01-01, 13: 39. ISSN 1471-2164. PMC 3287961 可免費查閱. PMID 22272718. doi:10.1186/1471-2164-13-39 可免費查閱. 
  15. ^ Berquist, Brian R.; DasSarma, Shiladitya. An Archaeal Chromosomal Autonomously Replicating Sequence Element from an Extreme Halophile, Halobacterium sp. Strain NRC-1. Journal of Bacteriology. 2003-10-15, 185 (20): 5959–5966. ISSN 0021-9193. PMC 225043 可免費查閱. PMID 14526006. doi:10.1128/JB.185.20.5959-5966.2003 （英語）. 
  16. ^ Coker, James A.; DasSarma, Shiladitya. Genetic and transcriptomic analysis of transcription factor genes in the model halophilic Archaeon: coordinate action of TbpD and TfbA. BMC Genetics. 2007-01-01, 8: 61. ISSN 1471-2156. PMC 2121645 可免費查閱. PMID 17892563. doi:10.1186/1471-2156-8-61 可免費查閱. 
  17. ^ Karan, R; DasSarma, P; Balcer-Kubiczek, E; Weng, RR; Liao, CC; Goodlett, DR; Ng, WV; Dassarma, S. Bioengineering radioresistance by overproduction of RPA, a mammalian-type single-stranded DNA-binding protein, in a halophilic archaeon. Applied Microbiology and Biotechnology. 2014, 98 (4): 1737–1747. PMC 4096848 可免費查閱. PMID 24292079. doi:10.1007/s00253-013-5368-x. 
  18. ^ Weiss, Rick. 'Superbugs' Could Benefit Humans. The Washington Post. 2007-09-25 [2016-07-11]. ISSN 0190-8286. （原始內容存檔於2016-12-29） （美國英語）. 
  19. ^ DasSarma, Shiladitya; Capes, Melinda D.; Karan, Ram; DasSarma, Priya. Amino Acid Substitutions in Cold-Adapted Proteins from Halorubrum lacusprofundi , an Extremely Halophilic Microbe from Antarctica. PLOS ONE. 2013-03-11, 8 (3): e58587. Bibcode:2013PLoSO...858587D. ISSN 1932-6203. PMC 3594186 可免費查閱. PMID 23536799. doi:10.1371/journal.pone.0058587 可免費查閱. 
  20. ^ BioTechniques - Antarctic Microbe's Survival Tricks Revealed. www.biotechniques.com. [2016-07-11]. （原始內容存檔於2016-09-13）. 
  21. ^ Extremophiles and Extraterrestrial Life. [2023-12-17]. （原始內容存檔於2023-12-17）. 
  22. ^ DasSarma, Shiladitya; Karan, Ram; DasSarma, Priya; Barnes, Susan; Ekulona, Folasade; Smith, Barbara. An improved genetic system for bioengineering buoyant gas vesicle nanoparticles from Haloarchaea. BMC Biotechnology. 2013-01-01, 13: 112. ISSN 1472-6750. PMC 3878110 可免費查閱. PMID 24359319. doi:10.1186/1472-6750-13-112 可免費查閱. 
  23. ^ DasSarma, P.; Negi, V. D.; Balakrishnan, A.; Kim, J. -M.; Karan, R.; Chakravortty, D.; DasSarma, S. Procedia of the 8th Vaccine & ISV Congress, Philadelphia, USA, 2015Haloarchaeal Gas Vesicle Nanoparticles Displaying Salmonella Antigens as a Novel Approach to Vaccine Development. Procedia in Vaccinology. 2015-01-01, 9: 16–23. PMC 4758358 可免費查閱. PMID 26900411. doi:10.1016/j.provac.2015.05.003. 
  24. ^ DasSarma, Shiladitya; DasSarma, Priya. Gas Vesicle Nanoparticles for Antigen Display. Vaccines. 2015-09-07, 3 (3): 686–702. PMC 4586473 可免費查閱. PMID 26350601. doi:10.3390/vaccines3030686 可免費查閱 （英語）. 

外部連結

取自「https://zh.wikipedia.org/w/index.php?title=希拉蒂亞·達薩馬&oldid=81230624」